Flemingsbergs församling i Huddinge är en kristen församling.

Flemingsbergs församling är en av fyra församlingar inom Huddinge pastorat i Huddinge kommun. Pastoratet tillhör Huddinge-Botkyrka kontrakt inom Stockholms stift och har sitt säte i Huddinge. Församlingen bildades genom sammanläggning av tidigare pastorat och utgör en del av den kyrkliga organisationen i kommunen. Som en av flera församlingar i pastoratet verkar Flemingsbergs församling med ett kristet uppdrag och deltar i det gemensamma arbetet inom pastoratet tillsammans med övriga församlingar.